6月5日，山東省第十二屆人民代表大會第二次會議召開，郭樹清當選山東省人民政府省長。

　　此前3月17日，郭樹清正式離開證監會，兩天后，郭樹清出現在山東省委擴大會議上，出任山東省委委員、常委、副書記。3月29日，山東省十二屆人大一次會議任命郭樹清為山東省副省長，并決定由其代理省長。

　　“對于其來說，一個極為重要的難題是怎么在山東厘清政府和市場的關系�！币晃簧綎|企業界人士說，“山東之前的高速發展其實也部分得益于強政府的推進，但在現在的發展環境下，這不適用了�！�

　　這個問題郭樹清在履職一開始就做出了闡述，在新一屆省政府第一次召開的廉政工作會議上，郭樹清就談及了政府和市場的關系。

　　“政府不是萬能的，許多事情由政府來做成本很高。”郭樹清說，“要切實轉變政府職能，下決心把該放的權力放下去，該由市場做的放給市場，社會能辦好的交給社會。”

　　由此，郭樹清提出山東要加快政府職能轉變，“創造全國領先的營商環境”。在其赴多地調研的過程中，都強調要創造良好的營商環境，以吸引更多投資者和創業者。

　　梳理公開報道發現，郭樹清入魯三個月內，已經赴山東全部十七個城市進行考察，主題則涉及轉方式調結構、加快城鎮化建設、優化營商環境以及加速西部隆起帶建設等內容。

　　在山東省轉方式調結構推動科學發展現場觀摩交流會，郭樹清對山東的經濟發展做出了自己的評價。

　　在郭樹清看來，山東的問題和差距在于產業結構不合理、科技創新能力不強、民營經濟差距較大、質量和效益有待提高。但他同時分析，認為山東的優勢在于區位優勢明顯、資源比較豐富、實體經濟基礎扎實、區域發展較為協調。

　　但問題猶在。根據相關省份公布的2012年全年的經濟運行數據，山東省第三產業增加值占GDP比重為40.0%，而廣東為50.7%，江蘇為43.8%。

　　郭樹清在他參加的山東省政府第一次全體會議上就指出，要加大工業結構調整力度，有效化解過剩產能，鼓勵發展高附加值的產品和行業，“努力拉長服務業短板，高度重視傳統生產生活服務業，加快發展現代服務業和創意產業”。

　　而在全國城鎮化浪潮的背景下，農業大省山東的城鎮化如何進行也是擺在這個學者型省長面前的一個巨大挑戰，郭樹清對于這一問題的答案是“用改革的辦法解決農村城鎮化建設土地與資金問題”。其表示，要加快農村土地產權制度改革和經營管理體制改革。

　　作為來自金融系統的官員，郭在其履職期間也試圖嘗試將更多的金融資源引入山東。國開行、農銀、上證交易所、深證交易所、全國社保基金理事會的掌門人均在這期間造訪山東。

　　而5月27日，郭樹清親自帶隊赴香港參加2013香港山東周，并在山東-國際金融機構(香港)早餐會上向香港金融界人士發出邀請參與山東金融業。