佛頭差點被賊盜走
建國后，該組古建筑群曾長年被當地村委會作為小學校舍、倉庫等使用，因一直缺乏維護，損壞日益嚴重。
如此珍貴的文物，卻只能呆在村子里任由風侵雨蝕。艾楠介紹，2 0 0 9年之前，這座始建于隋唐時期的寺廟僅存門殿、東西配殿和大殿這幾座主體建筑。雖然貴為濟南市第一批重點文物保護單位，但這些建筑卻破損嚴重。
在正殿中，保存有濟南地區最大的單體石佛造像，高6米多。村民們介紹，在解放前后，興國寺其它大殿里的佛像全被毀壞了，唯有這尊大佛一直安詳地端坐在此，沒有人能破壞得了它。這在村民們看來，這尊大佛充滿了神秘不可侵犯的色彩。
2001年，100多個盜取文物者盯上了佛像的頭。當時，他們爬進院墻來到大殿之中，用盡各種辦法將佛首給卸了下來，可由于佛頭重三四噸，小偷們折騰了半天也沒弄得動。由于害怕驚擾了村民，只得放棄。很久之后，涉案的小偷因其他事情被警方抓獲，從他們口中村民和警方才得知他們來過章丘盜取佛頭。后來，村民們打開大殿，發現佛首滾落在地上，才請工匠重新把佛首鑲上。
千年前磚瓦繼續使用
2010年，濟南市文物部門開始對興國寺進行整修。在維修過程中，文物部門著重保護了興國寺的原貌。對于瓦、磚、梁架、斗拱等材料決定繼續使用。而對于破損嚴重的瓦件，尤其是勾頭和滴水，通過翻模進行了原樣復制，從而達到與以前構件樣式的一致。也就是說，如今修繕完畢后，還有可能摸到一千年前的瓦呢。
很多探訪過興國寺的“驢友”都對寺中的大殿外槽墻體內部檐柱記憶猶新。經過解剖，考古人員發現大殿的檐柱原是使用了外形沒有處理過的棗木，每個直徑多達四五十厘米，保存良好，可以繼續使用。“能夠保存一千多年的木質品自然十分珍貴，對于它們，我們會盡可能保存。”艾楠表示。
正因為在保護過程中采取了上述措施，興國寺保護工程才能最終入圍全國十佳文物保護工程。
